凈信前處理儀器讓致病微生物無(wú)所遁形

不久前，"中國宏基因組學(xué)*二代測序技術(shù)檢測感染病原體的臨床應用專(zhuān)家共識"在《中華傳染病雜志》發(fā)布，這是全球首篇針對所有感染性疾病的宏基因組學(xué)臨床應用專(zhuān)家共識。二代測序病原檢測技術(shù)越來(lái)越普及，宏基因組測序（mNGS）描述了樣本中存在的所有DNA或RNA信息，此技術(shù)能夠分析整個(gè)微生物組以及患者樣本中的人類(lèi)宿主基因組或轉錄組，避免用藥失誤，把握最佳治療時(shí)間，做到精準醫療。

對于不明原因的疾病，及早的進(jìn)行感染病原微生物高通量的檢測，是一種行之有效的辦法，為醫生早期診斷提供機會(huì )，為患者贏(yíng)得治療的時(shí)間，又可以節省不必要的費用。2014年新英格蘭醫學(xué)雜志報道過(guò)一個(gè)通過(guò)宏基因組輔助檢測治愈了一位原因不明、反復發(fā)熱、具有癲癇及腦積水癥狀的14歲男孩的案例，這是歷史上首個(gè)宏基因組臨床應用成功的案例。文章報道這個(gè)常規治療及病原篩查都沒(méi)有確診原因，隨后對腦脊液樣本mNGS篩查，結合生物信息學(xué)分析結果發(fā)現一種可疑的致病菌 leptospira infection，隨后針對性地使用萬(wàn)古霉素和頭孢吡肟治療后出院。該團隊確認這是一種尚未報道過(guò)的病原微生物。由此，臨床宏基因組正式應用于微生物診斷拉開(kāi)了帷幕。

那么，什么是病原微生物？病原微生物是指可以侵犯人體，引起感染甚至傳染病的微生物，或稱(chēng)病原體。病原體中，以細菌和病毒的危害性最大。病原微生物指朊毒體、寄生蟲(chóng)（原蟲(chóng)、蠕蟲(chóng)、醫學(xué)昆蟲(chóng)）、真菌、細菌、螺旋體、支原體、立克次體、衣原體、病毒。病原微生物已成為全球關(guān)注的焦點(diǎn)。據WHO統計，在中國，感染性疾病占所有疾病的50%以上。面對重癥感染患者，能否快速確認感染病原體，成為后續對癥治療的關(guān)鍵。
醫學(xué)檢驗中采集病原微生物用于mNGS的樣本樣本類(lèi)型主要有靜脈血、腦脊液、肺泡灌洗液、痰液、胸水和腹水、咽部分泌物、局灶穿刺物、組織等多種類(lèi)型。mNGS的檢測流程可以大致分為5個(gè)步驟：核酸提取、文庫構建、上機測序、生信分析與報告解讀。對病原微生物進(jìn)行測序前處理過(guò)程中關(guān)鍵的一步就是核酸提取，因為病原微生物核酸提取效果的好壞，會(huì )直接影響到后續測序的成敗。

然而上核酸提取儀之前，都需要進(jìn)行樣品的前處理。前處理設備的好壞直接影響著(zhù)后序檢測數據的精確度、靈敏度，規范的操作也是其中重要的條件；另外，檢測的樣品如果被外部所污染，也可能會(huì )影響檢測的結果。上海凈信在前處理這塊專(zhuān)注了十幾年，研磨儀系列產(chǎn)品上市十幾年以來(lái)，經(jīng)得住客戶(hù)和市場(chǎng)的驗證，在業(yè)內具有良好的口碑。在醫學(xué)檢驗應用這塊也廣被客戶(hù)認可。
凈信研磨儀能將任何來(lái)源(包括土壤、植物和動(dòng)物的組織/器官、細菌、酵母、真菌、孢子、古生物標本等)的原始DNA、RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行提取和純化。 只要將樣品和研磨球放入研磨儀內（配置研磨罐或離心管/適配器），在高頻擺動(dòng)作用下，研磨球在研磨儀內來(lái)回高速撞擊及摩擦，在非常短的時(shí)間內便可完成樣品的研磨、粉碎、混合及細胞破壁。